L’ISTITUTO COMPRENSIVO NETTUNO II è stato istituito nell’anno scolastico 2012/2013, in seguito al riordino dell’assetto delle istituzioni scolastiche, con l’accorpamento del 3° Circolo Didattico “S.M. Goretti” con il plesso di Scuola Secondaria di primo grado Via Canducci.
Dall'anno scolastico 2012/2013 fino al 2018/2019 l'istituto è stato caratterizzato da un periodo di diverse reggenze.
Dall' a.s. 2019/2020 ha un Dirigente Scolastico di ruolo.
L’Istituto è ubicato nel quartiere di Cretarossa e comprende i seguenti plessi:
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Sede di via Canducci – Scuola Secondaria di primo grado e ufficio di Presidenza;
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Plesso S. Maria Goretti di via Teulada – Scuola Primaria, più gli uffici amministrativi e ufficio di Presidenza;
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Plesso Andersen di via dell’Olmo – Scuola dell’Infanzia;
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Plesso Fratelli Grimm nel nuovo plesso dell'infanzia di Via Canducci che è stato riqualificato.
Si è provveduto alla digitalizzazione infrastrutturale degli edifici scolastici.
L'ufficio amministrativo conta su un Direttore dei Servizi Generali e Amministrativi e 5 assistenti amministrativi di ruolo, l'organico dei collaboratori scolastici è prevalentemente stabile e di ruolo.
L'organico docente è composto da insegnanti prevalentemente di ruolo.